69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2784 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  100 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  98.97 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  98.45 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  94.94 
 
 		 194 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  88.66 
 
 		 193 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  88.66 
 
 		 193 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  78.35 
 
 		 193 aa  258  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  39.39 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  39.39 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  39.39 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  37.8 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  37.8 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  37.8 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  37.8 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  37.8 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  37.8 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  37.8 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  37.8 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  38.18 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  37.58 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  38.18 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  38.18 
 
 		 188 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  36.97 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  36.36 
 
 		 190 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  40.74 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  40.12 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  40.74 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  39.51 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  35.22 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  36.16 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  34.48 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  34.48 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  38.85 
 
 		 164 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  35.44 
 
 		 174 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  37.35 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6167  phasin family protein  33.54 
 
 		 174 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  32.93 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  38.18 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  31.61 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  33.14 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  33.96 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  33.53 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  32.1 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  30 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  34.57 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  32.7 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  28.31 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  31.46 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  35.12 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  33.95 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  31.71 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  28.92 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  28.82 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  33.14 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  33.92 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  25.75 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  30.08 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1972  putative phasin protein  28.99 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  30.28 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  33.95 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  32.89 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  27.07 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  28.16 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  26.4 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  25.16 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0132  phasin family protein  25.4 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000741228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1801  phasin family protein  27.27 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>