64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0025 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0025  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  38.99 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  38.99 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  38.99 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  38.36 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  38.36 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  38.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  38.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  38.99 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  38.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  38.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  38.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  38.99 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  38.99 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  38.36 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  38.36 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  37.74 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  38.36 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  36.88 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  37.74 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  37.74 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  35.62 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  35.62 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  38.26 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  35.5 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  37.33 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  39.13 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  36 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  37.2 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  35.44 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  38.93 
 
 		 187 aa  87.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  32.69 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  38.26 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  36.36 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3309  phasin family protein  34.9 
 
 		 192 aa  84.3  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.815805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  29.93 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  31.68 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  30.77 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  34.23 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2304  phasin  30.43 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3019  phasin  29.71 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00196796  normal  0.647468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  30.99 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3122  phasin  31.47 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2784  phasin family protein  31.06 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.954399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0875  phasin family protein  33.33 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000437683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2825  phasin family protein  31.82 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2692  phasin family protein  31.82 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468731  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  30.97 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  24.52 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3102  phasin family protein  28.83 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.499435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3422  phasin  32.52 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.14313e-25  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  31.16 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  29.55 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  29.85 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2336  phasin  28.47 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2159  phasin  28.79 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2773  phasin family protein  28.79 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0542  phasin family protein  27.21 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3423  phasin  24.31 
 
 		 197 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  0.962237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1532  phasin  31.69 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000615766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  27.71 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3915  phasin family protein  30.94 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0319  phasin  34.15 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2125  phasin family protein  22.63 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0351687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>