28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03930  phasin family protein  100 
 
 		 153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23670  phasin protein  34.78 
 
 		 186 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000014233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  28.93 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  28.93 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  28.93 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  29.75 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  28.93 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  29.75 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  29.75 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  29.75 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  29.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  28.1 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  29.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  29.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  29.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  29.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  28.1 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  30.25 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  28.1 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  29.41 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  27.01 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4308  phasin family protein  30.09 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  27.05 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  26.45 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2018  phasin family protein  25 
 
 		 182 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0441052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  27.05 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  27.05 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6103  phasin  23.81 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>