39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1874 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1874  phasin  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5545  phasin family protein  58.64 
 
 		 160 aa  173  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0800573  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4225  phasin family protein  32.9 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  35.07 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  38.46 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  38.14 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  38.14 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  38.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  38.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  38.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  38.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  38.14 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  38.14 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  35.87 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  35.05 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  35.05 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  36.08 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  35.05 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  35.05 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  35.05 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  36.08 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  32.29 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  32.94 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  32.94 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3864  phasin  34.09 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  30.21 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2358  phasin family protein  34.88 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4349  phasin  27.52 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2140  phasin  30.68 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4922  phasin  29.63 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3088  phasin  29.55 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000310339  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3606  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.11217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  29.25 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1612  phasin family protein  30.33 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000706224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  30.68 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3470  phasin family protein  28.74 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.103748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  29.9 
 
 		 182 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1992  phasin family protein  27.54 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000361107 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6019  phasin  28.09 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>