30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1084 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 44 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158964  normal  0.794505 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0737  phasin family protein  91.18 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.986561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1200  phasin  67.65 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000122357  normal  0.77319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1467  phasin family protein  68.75 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00148952  normal  0.858404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2588  phasin family protein  65.62 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272544  hitchhiker  0.000478575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4742  phasin family protein  61.76 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164964  normal  0.333304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1544  phasin  65.62 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000489464  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2171  phasin family protein  65.62 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1136  phasin family protein  65.62 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2151  phasin family protein  65.62 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0395021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2044  phasin family protein  65.62 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2494  phasin family protein  61.76 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000038642  normal  0.0253479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2134  phasin family protein  65.62 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00690855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5943  phasin  65.62 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5440  phasin  65.62 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1366  phasin family protein  61.76 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000804871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1716  phasin family protein  62.5 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1497  phasin family protein  62.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2664  phasin family protein  62.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2609  phasin family protein  62.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3095  phasin family protein  62.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2225  phasin family protein  62.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1867  phasin family protein  62.5 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2742  phasin-like protein  62.5 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1605  hypothetical protein  65.62 
 
 		 193 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000106096  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1766  phasin family protein  61.76 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1942  phasin family protein  62.5 
 
 		 193 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000889348  hitchhiker  0.00205341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1614  phasin family protein  62.5 
 
 		 193 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0000449838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2554  phasin family protein  55.88 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697191  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1506  hypothetical protein  62.5 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000313141  normal  0.357247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>