61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1478 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  100 
 
 		 135 aa  277  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  65.93 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  67.16 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  58.91 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  42.52 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  36.36 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  39.52 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  33.86 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  32.28 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  37.7 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  33.86 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  40.52 
 
 		 596 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  32.74 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  33.07 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  41.67 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2411  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  36.04 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  34.21 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  29.92 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  29.92 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  29.92 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  30.71 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  31.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  38.04 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  31.5 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  35.09 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  28.07 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  36.67 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  31.25 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  32.03 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  33.64 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  32 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  34.55 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  36.7 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  34.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  31.3 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  29.92 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  32.28 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  31.78 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>