48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6777 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  61.9 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  58.73 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  58.91 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  47.29 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  39.37 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  35.88 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  40.31 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  32.5 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  35.48 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  29.55 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  34.38 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  32.03 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  32.81 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  33.59 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  33.59 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  33.59 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  33.59 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  33.59 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  33.59 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  32.81 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  38.28 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  31.87 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  27.91 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  27.91 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  27.91 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  34.78 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  30.47 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  33.04 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  32.54 
 
 		 596 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  30.23 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  33.85 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  31.85 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  29.36 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  26.96 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  34.13 
 
 		 365 aa  40.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  37.11 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  35.38 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0461  AIG2 family protein  28.04 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.776167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  31.37 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>