17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1325 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  100 
 
 
140 aa  276  8e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  39.82 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  40.91 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  41.41 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  38.52 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  35.9 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  34.96 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  30.83 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  32.06 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0976  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.371568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  35.03 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  41.86 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  33.33 
 
 
365 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  32.52 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>