34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4134 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  74.24 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  67.16 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  58.73 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  37.31 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  34.65 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  37.9 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  36.04 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  37.39 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  36.75 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  35.82 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  37.93 
 
 		 596 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2411  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  36.36 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  31.78 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  34.48 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  33.83 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  29.13 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  37.59 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  37.97 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  30.83 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1872  hypothetical protein  32.05 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0940466  hitchhiker  0.00129233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 124 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  35.14 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  35.14 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>