60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5497 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  100 
 
 
143 aa  295  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  39.37 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  37.69 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  35.16 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  34.65 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  34.33 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  34.31 
 
 
268 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  32.28 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  32.03 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  31.34 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  33.07 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  32.82 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  28.36 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  32.06 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  32.06 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  32.06 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  30.71 
 
 
140 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  29.5 
 
 
276 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  29.41 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  31.5 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  34.15 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  27.61 
 
 
137 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  27.07 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  31.2 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  27.07 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  27.07 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  30.4 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  28.79 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  30.4 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  28.8 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  27.41 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  28.8 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  28.8 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  29.5 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  35.71 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  30.83 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0461  AIG2 family protein  31.07 
 
 
97 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.776167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  29.91 
 
 
132 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  29.6 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  29.6 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  29.6 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  29.6 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  29.6 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  28.8 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  29.6 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  29.69 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  32.81 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  27.91 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>