24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  220  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  65.14 
 
 
118 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2411  hypothetical protein  64.77 
 
 
88 aa  120  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1467  AIG2 family protein  48.6 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.394219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2005  hypothetical protein  40.37 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.842355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3246  AIG2 family protein  42.34 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0705888  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  40.35 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  37.5 
 
 
365 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  37.39 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  35.65 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  37.5 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  29.2 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  30.09 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  29.46 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  27.43 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  29.2 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  27.43 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  27.43 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  28.32 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  34.78 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  33.04 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  26.55 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  26.55 
 
 
127 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  34.48 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>