23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2184 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  297  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  35.97 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0809  AIG2 family protein  37.78 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  29.66 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  35.04 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2381  AIG2 family protein  37.5 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  28.97 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  37.1 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  39.47 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  32.39 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  35.96 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  40.74 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  40.74 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  32.35 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  35.45 
 
 
365 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0347  AIG2 family protein  46.3 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  34.38 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  40.18 
 
 
596 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0998  AIG2 family protein  34.51 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1467  AIG2 family protein  31.25 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.394219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  34.78 
 
 
132 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  35.65 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>