25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1412 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  96.58 
 
 
146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  38.69 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  34.74 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  32.85 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0809  AIG2 family protein  26.62 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  25.85 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  32.58 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  29.08 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  36 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  30.53 
 
 
148 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  33.65 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  33.65 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0347  AIG2 family protein  24.09 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  24.57 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  30.6 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  22.6 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  22.67 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  25.18 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  21.92 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1921  hypothetical protein  28.15 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.766298  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  21.23 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  30.19 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  44.44 
 
 
276 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  33.33 
 
 
126 aa  40  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>