31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0347 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0347  AIG2 family protein  100 
 
 
142 aa  290  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0809  AIG2 family protein  56.74 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  25.55 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  35.51 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  24.82 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  35.56 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  34.51 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  36.29 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  33.87 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  32.61 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  32.61 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  33.06 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  37.04 
 
 
276 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  30.66 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  33.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  33.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  33.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  33.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  33.57 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  33.58 
 
 
137 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  32.2 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  31.62 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  29.6 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  29.93 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  31.75 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  36.84 
 
 
596 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  29.6 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  31.21 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  31.5 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  33.09 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1816  AIG2 family protein  30.83 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>