51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1507 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  307  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  39.42 
 
 
146 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  38.69 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  37.12 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  35.43 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  37.21 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  34.13 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  36.51 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  36.51 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  31.5 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  39.64 
 
 
596 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  31.82 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  31.82 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  31.54 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  31.82 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  29.55 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  30.3 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  29.55 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  29.55 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  30.3 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  31.54 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1921  hypothetical protein  33.58 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.766298  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  27.86 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  30.3 
 
 
127 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1816  AIG2 family protein  32.54 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  26.11 
 
 
174 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  33.04 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  33.04 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  26.06 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  26.75 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  26.11 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0809  AIG2 family protein  30.83 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1241  hypothetical protein  28.08 
 
 
162 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100284  normal  0.175855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  27.86 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  53.33 
 
 
276 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  28.89 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  34.51 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  27.74 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  31.34 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0998  AIG2 family protein  29.63 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  31.88 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2479  AIG2 family protein  31.54 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  28.07 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  26.96 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  29.08 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  29.55 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  31.97 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1701  AIG2 family protein  30.93 
 
 
371 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  31.97 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  26.47 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>