12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1241 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1241  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  323  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100284  normal  0.175855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  43.92 
 
 
174 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  42.57 
 
 
174 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  47.65 
 
 
155 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  41.89 
 
 
174 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  40.41 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  38.61 
 
 
193 aa  90.5  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  36.36 
 
 
160 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  28.08 
 
 
152 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  26.9 
 
 
148 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  28.47 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  41.51 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>