20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0959 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  361  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  90.17 
 
 
174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  86.13 
 
 
174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  79.76 
 
 
185 aa  280  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  45.95 
 
 
193 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  48.03 
 
 
155 aa  127  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  42 
 
 
160 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1241  hypothetical protein  42.57 
 
 
162 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100284  normal  0.175855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  30.71 
 
 
144 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  28.4 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  28.4 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  26.75 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  31.87 
 
 
132 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  28.4 
 
 
148 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  35.64 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  27.97 
 
 
132 aa  44.3  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  21.92 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  24.24 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  22.45 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  28.07 
 
 
324 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>