20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1863 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  362  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  86.71 
 
 
174 aa  310  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  86.13 
 
 
174 aa  305  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  81.33 
 
 
185 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  46.52 
 
 
193 aa  144  9e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  41.33 
 
 
160 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1241  hypothetical protein  43.92 
 
 
162 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100284  normal  0.175855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  31.29 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  47.17 
 
 
134 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  22.6 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  29.19 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  26.11 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  27.97 
 
 
148 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  27.97 
 
 
148 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  31.11 
 
 
324 aa  47.8  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  25.61 
 
 
133 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  29.5 
 
 
148 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  31.91 
 
 
148 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  21.92 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>