16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0454 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  100 
 
 
160 aa  323  5e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0959  hypothetical protein  42 
 
 
174 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  41.33 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  43.79 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  40.35 
 
 
193 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  41.48 
 
 
185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1241  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100284  normal  0.175855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  27.4 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  43.14 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  30.06 
 
 
132 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  31.58 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  30.19 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  29.41 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  23.6 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  26.47 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>