18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0302 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  257  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  36.43 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  33.86 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  36.04 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  41.57 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  35.2 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  39.23 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  29.55 
 
 
132 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  30.06 
 
 
160 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  30.65 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  36.59 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  36.59 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  36.59 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  34.48 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  29.91 
 
 
143 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  33.72 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>