14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0958 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  107  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  41.05 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  40.44 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  35 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  31.34 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  29.32 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  33.8 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  29.05 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  27.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  29.63 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  30.28 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>