54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0180 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  47.29 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  45.24 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  46.49 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  42.31 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  42.52 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  35.16 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  30.6 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  33.87 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  32.8 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  34.26 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  32.8 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  31.34 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  32 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  32 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  35.65 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  34.19 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  32.03 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  35.16 
 
 		 365 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  33.59 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  33.59 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  31.2 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  31.03 
 
 		 324 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  42.86 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  42.86 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  39.76 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  30.65 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  31.2 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  28.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  35.65 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  29.41 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  37.93 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  31.39 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  30 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1467  AIG2 family protein  34.23 
 
 		 111 aa  40.8  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.394219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  28.23 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  28.23 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  28.23 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  36.9 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.077376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>