14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1467 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1467  AIG2 family protein  100 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.394219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  48.6 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  50.47 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2005  hypothetical protein  36.7 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.842355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2411  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3246  AIG2 family protein  34.23 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0705888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  30 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  33.65 
 
 		 365 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  34.21 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  27.52 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  28.04 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  34.23 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  31.86 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>