28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5268 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  100 
 
 
140 aa  273  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  40.87 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  42.11 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  26.53 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  29.71 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  26.53 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  30.66 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  40.19 
 
 
365 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  29.37 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  27.86 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  35.04 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  34.31 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  40.62 
 
 
132 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1921  hypothetical protein  34.27 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.766298  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1467  AIG2 family protein  36.84 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.394219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1499  AIG2 family protein  31.03 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  29.29 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  35.9 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  34.15 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0302  hypothetical protein  26.77 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.252086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0454  AIG2 family protein  26.92 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.576531  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2005  hypothetical protein  30.97 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.842355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  27.69 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  37.41 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1863  hypothetical protein  30.13 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.378526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  35.71 
 
 
596 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  30.57 
 
 
174 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1684  AIG2 family protein  29.71 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.573773  decreased coverage  0.0000669413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>