17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0553 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  100 
 
 
365 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5650  hypothetical protein  32.19 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  40.19 
 
 
140 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  35.24 
 
 
118 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0258  AIG2 family protein  37.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  35.45 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  35.16 
 
 
130 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1467  AIG2 family protein  33.65 
 
 
111 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.394219  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3703  AIG2 family protein  34.45 
 
 
117 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  32.73 
 
 
132 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1894  hypothetical protein  36.46 
 
 
140 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6923  hypothetical protein  35.59 
 
 
124 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657088  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3035  AIG2 family protein  40 
 
 
135 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1655  AIG2 family protein  33.91 
 
 
112 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4897  hypothetical protein  29 
 
 
106 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376181  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  37.82 
 
 
135 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>