52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3977 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  74.24 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  65.93 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  61.9 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  46.49 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  38.06 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  33.86 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  38.89 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0302  hypothetical protein  35.2 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.285091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  40 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  40 
 
 		 596 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  35.34 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10020  hypothetical protein  35.65 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0027281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  37.5 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  33.85 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  33.04 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2479  AIG2 family protein  34.48 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.991817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  29.23 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  33.08 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  29.37 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  31.67 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  29.37 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  29.37 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  32.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  32.31 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2184  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  31.06 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2411  hypothetical protein  31.76 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  32.31 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  28.57 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  27.82 
 
 		 324 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1872  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0940466  hitchhiker  0.00129233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  37.82 
 
 		 365 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  31.63 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  35.48 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  29.37 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  30.43 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  29.71 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  30.94 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  34.15 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  33.09 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  35.96 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  33.08 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>