78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3623 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  244  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  74.56 
 
 
115 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  72.81 
 
 
116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  70.18 
 
 
114 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  70.59 
 
 
120 aa  173  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0461  AIG2 family protein  79.17 
 
 
97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.776167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  62.16 
 
 
113 aa  155  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  61.26 
 
 
113 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  58.41 
 
 
114 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  58.41 
 
 
114 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  58.41 
 
 
114 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  58.41 
 
 
114 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  58.41 
 
 
114 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  57.02 
 
 
114 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  41.82 
 
 
115 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  41.82 
 
 
115 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  39.09 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  37.72 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  30.4 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  36.36 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  35.71 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  35.71 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  35.34 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  34.82 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  34.48 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  35 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  37.17 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  33.93 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  35.45 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  34.71 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  34.82 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  29.81 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  39.24 
 
 
268 aa  57.4  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  33.61 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  30.33 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  31.3 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  33.01 
 
 
596 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  30.08 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  29.41 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  29.41 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  28.57 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  29.01 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  28.57 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  28.69 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  29.01 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  29.01 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  31.3 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  28.57 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0302  hypothetical protein  26.55 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.252086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  29.01 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  31.09 
 
 
126 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  26.89 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  29.37 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  29.92 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  29.63 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  24.6 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  28.12 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  29.13 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  29.77 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  29.57 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  27.91 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  28.8 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  27.13 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  30.11 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  31.75 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  25.4 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  25.4 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  28.23 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  30.95 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>