63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4571 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  100 
 
 
124 aa  254  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  42.86 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  39.81 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  44.19 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  40.37 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  44.19 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  43.02 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  44.19 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  39.25 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  38.89 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  38.78 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  37.27 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  41.86 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31817  predicted protein  34.19 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.993737  normal  0.0863689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  37.96 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  37.84 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  40.7 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  38.24 
 
 
596 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0302  hypothetical protein  35.09 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.252086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  36.36 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  36.05 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2756  AIG2 family protein  37.14 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  35.96 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  56.25 
 
 
324 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  34.15 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  30.43 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  32.46 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  33.71 
 
 
268 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  38.04 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  29.63 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  31.13 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  32.45 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  30.19 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  31.96 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2766  hypothetical protein  34.44 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  37.8 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  28.15 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  30.93 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  30.34 
 
 
276 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  31.68 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  28.24 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  33.08 
 
 
147 aa  40  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  28.24 
 
 
116 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2844  hypothetical protein  37.1 
 
 
140 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0533906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>