89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4810 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  234  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  92.92 
 
 
113 aa  219  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  92.04 
 
 
113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  90.27 
 
 
114 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  68.75 
 
 
114 aa  166  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  63.72 
 
 
116 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  62.83 
 
 
115 aa  157  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  64.91 
 
 
120 aa  156  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  58.41 
 
 
118 aa  152  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  58.41 
 
 
118 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  58.41 
 
 
118 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0461  AIG2 family protein  59.14 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.776167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  47.27 
 
 
115 aa  107  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  46.36 
 
 
115 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  44.55 
 
 
115 aa  100  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  39.47 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  38.79 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  35.83 
 
 
268 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  38.79 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  37.93 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  37.93 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  37.07 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  38.94 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  38.05 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  38.6 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  38.05 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  30.43 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  33.65 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  37.93 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  38.05 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  35.65 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  31.4 
 
 
276 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  37.5 
 
 
596 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  33.33 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  32.5 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  32.52 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  32.52 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  33.87 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  34.78 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  32.77 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  32.77 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  34.74 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  37.12 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  30.89 
 
 
127 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  30.89 
 
 
127 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  30.08 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  30.08 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  34.45 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  35.4 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0302  hypothetical protein  27.68 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.252086  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0972  hypothetical protein  34.78 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  33.59 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  32.03 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  33.07 
 
 
139 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  30.95 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  32.08 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  31.58 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  30.4 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  30.23 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  30.4 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  29.13 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  27.69 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  27.69 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  27.69 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1872  hypothetical protein  28.15 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0940466  hitchhiker  0.00129233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  30.95 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  36.17 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  26.15 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  29.6 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  27.69 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  30.4 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0347  AIG2 family protein  30.94 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0998  AIG2 family protein  29.59 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>