80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1868 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  100 
 
 		 142 aa  282  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  48.3 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  43.14 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  41.41 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  40.94 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  37.98 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  37.69 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  37.21 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  37.21 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  37.21 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  37.21 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  37.21 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  36.43 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  37.9 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  36.15 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  36.51 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  36.15 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  36.15 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  36.15 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  35.38 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  43.22 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  32.58 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  43.22 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  42.37 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  32.56 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  42.74 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  43.22 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  41.6 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  42.37 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  40.68 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  39.06 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  41.53 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  41.53 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  34.35 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  38.46 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  33.06 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  32.8 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  37.3 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  32 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  35.25 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  32 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  31.45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  34.68 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  32.03 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  36.89 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  31.45 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  37.9 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  30.65 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1872  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0940466  hitchhiker  0.00129233 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  44.16 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  31.36 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  36.13 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  35 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  34.45 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  34.45 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  34.45 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  34.45 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  34.45 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  32.26 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  35.29 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  34.96 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  32.5 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  32.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  34.45 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  30.65 
 
 		 268 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0461  AIG2 family protein  31.76 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.776167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  34.43 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  30.95 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  30.95 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  30.95 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>