53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2861 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  284  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  45.73 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  48.3 
 
 
142 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  39.42 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  43.66 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  43.07 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  42.55 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  39.42 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  39.46 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  39.46 
 
 
152 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  39.46 
 
 
152 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  39.46 
 
 
152 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  38.52 
 
 
138 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  39.46 
 
 
144 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  39.46 
 
 
144 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  38.69 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  39.42 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  39.1 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  39.42 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  39.42 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  39.42 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  38.69 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  38.69 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  39.57 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  41.09 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  39.37 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  39.84 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  39.37 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  38.64 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  40.31 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  39.53 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  39.53 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  38.76 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  40.31 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  37.4 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  34.62 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  28.03 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  34.21 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  39.24 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  33.33 
 
 
128 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  33.77 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  30.53 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  32 
 
 
268 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  34.18 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  34.18 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  26.32 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  33.09 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  33.33 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  25.56 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  38.75 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  24.81 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  24.81 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  38.75 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>