68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1355 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  82.22 
 
 		 139 aa  222  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  81.62 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  57.25 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  58.78 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  57.81 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  56 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  56.82 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  54.96 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  54.96 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  54.96 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  54.96 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  54.96 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  56.59 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  54.96 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  56.59 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  56.59 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  56.06 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  53.85 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  54.55 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  53.08 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  33.94 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  37.69 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  39.57 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  31.34 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  31.3 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  32.84 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  29.85 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  29.1 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  29.93 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  29.2 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  29.2 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  29.01 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  35.07 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  29.2 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  29.1 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  32.61 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  36.15 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  38.14 
 
 		 596 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  30 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  38.27 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  28.35 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  29.51 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  31.01 
 
 		 268 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  28.91 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  29.92 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  29.13 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  29.13 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  29.13 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  29.13 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  29.13 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  30.16 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  28.47 
 
 		 148 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  33.75 
 
 		 115 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  27.34 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  34.55 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  32.54 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  30.77 
 
 		 153 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>