59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2100 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  337  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  45.73 
 
 
142 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  42.86 
 
 
142 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  36.36 
 
 
139 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  36.36 
 
 
140 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  36.31 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  36.09 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  36.31 
 
 
133 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  34.76 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  36.69 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  36.69 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  36.69 
 
 
152 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  36.9 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  34.32 
 
 
137 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  35.67 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  34.32 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  33.14 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  32.54 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  33.14 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  33.14 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  40.22 
 
 
276 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1872  hypothetical protein  32.04 
 
 
133 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0940466  hitchhiker  0.00129233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  42.25 
 
 
128 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  31.91 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  33.67 
 
 
268 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  37.33 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  36 
 
 
127 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  36 
 
 
127 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  30.85 
 
 
127 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  29.79 
 
 
127 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  29.79 
 
 
127 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  37.62 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  43.24 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  34.67 
 
 
127 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  43.84 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  41.25 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  30.49 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  41.43 
 
 
128 aa  44.7  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  32.68 
 
 
131 aa  44.3  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  30.72 
 
 
147 aa  44.3  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  30.08 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  32.68 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  32.76 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  37.33 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  29.94 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  37.33 
 
 
126 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  32.68 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  30.92 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  37.5 
 
 
135 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  39.56 
 
 
596 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4226  AIG2 family protein  35.82 
 
 
324 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  38.82 
 
 
119 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  40 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  37.11 
 
 
132 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  30.07 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>