87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1293 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  100 
 
 		 139 aa  278  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  98.57 
 
 		 140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  82.22 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  60.31 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1993  hypothetical protein  58.78 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000345283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1373  AIG2 family protein  59.23 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000374394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  59.2 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  59.09 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  58.33 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1646  hypothetical protein  57.69 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101834  normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2491  AIG2 family protein  56.15 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130947  hitchhiker  0.0029011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  57.58 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2476  hypothetical protein  55.73 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000129108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2094  hypothetical protein  55.73 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1367  hypothetical protein  55.73 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3219  hypothetical protein  55.73 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2530  hypothetical protein  55.73 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1592  hypothetical protein  55.73 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  58.14 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  58.14 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  58.14 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2100  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.077376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2861  hypothetical protein  43.66 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  40.94 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  38.35 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  38.35 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  38.52 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  30 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  30.08 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  38.35 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  34.53 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  36.8 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  36.64 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  36.51 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  38.1 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  35.04 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1440  AIG2 family protein  37.59 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  29.01 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  28.46 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  30.08 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  29.85 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  28.57 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  27.82 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  36.51 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  28.57 
 
 		 276 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  27.82 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  28.46 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  27.07 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  39.32 
 
 		 596 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  29.41 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  31.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  35.82 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  33.33 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  41.25 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  41.98 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2437  AIG2 family protein  28.35 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  30.71 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  29.13 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  33.07 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  33.07 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  33.07 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  33.07 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  33.07 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  31.01 
 
 		 268 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2479  AIG2 family protein  31.78 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  29.46 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  42.86 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1674  hypothetical protein  30.57 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0386058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1816  AIG2 family protein  34.96 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  28.12 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  28.12 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  28.12 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  30 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  28.15 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3843  hypothetical protein  30.5 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.173317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0958  hypothetical protein  30.28 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.430351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>