17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4141 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4141  AIG2 family protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  37.69 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  36.36 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  35.88 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  38.06 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  37.31 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1872  hypothetical protein  30.08 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0940466  hitchhiker  0.00129233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0180  hypothetical protein  30.6 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0195719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  32.2 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1962  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  33.04 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1230  AIG2 family protein  31.58 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1293  AIG2 family protein  31.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1355  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  31.3 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1325  AIG2 family protein  34.15 
 
 		 140 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>