54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0461 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0461  AIG2 family protein  100 
 
 
97 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.776167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  79.17 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  79.17 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  79.17 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  72.16 
 
 
120 aa  147  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  70.97 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  67.01 
 
 
116 aa  143  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  66.67 
 
 
115 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  61.29 
 
 
113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  60.22 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  59.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  59.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  59.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  59.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  59.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  59.14 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  42.11 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  42.11 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  40.43 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  38.78 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  32.32 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  38.95 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  38.2 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  37.04 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  35.71 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  37.04 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  35.71 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  37.04 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  35.8 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  37.04 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  36.25 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  35 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  38.98 
 
 
276 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  36.25 
 
 
128 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  29.07 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  34.57 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  29.41 
 
 
268 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  33.75 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  29.13 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  28.16 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  28.16 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  28.16 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5497  AIG2 family protein  31.07 
 
 
143 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000234358  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1868  AIG2 family protein  31.76 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  30.1 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0212  AIG2 family protein  34.65 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6777  hypothetical protein  28.04 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>