71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3755 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3755  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001692  hypothetical protein  38.95 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00781  hypothetical protein  38.95 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  36.3 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31817  predicted protein  45.16 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.993737  normal  0.0863689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  36.28 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  37.27 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0302  hypothetical protein  38.04 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.252086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2124  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2246  AIG2 family protein  28.7 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  32.35 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  36.94 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  36.89 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  35.4 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0400  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  36.45 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  30.97 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  36.89 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3770  AIG2 family protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  36.89 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4792  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3785  AIG2 family protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4701  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4859  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5740  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  36.89 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04057  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.080057  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4476  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04093  hypothetical protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0958094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2841  btrG family protein  35.34 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0360163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  35.64 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4810  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4691  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4680  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0507646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4831  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4776  hypothetical protein  34.74 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.121823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  35.92 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  35.92 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  28.57 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2825  butirosin biosynthesis protein BtrG  34.48 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.300443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  33.62 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  34.31 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1383  hypothetical protein  36.04 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.505208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0699  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  47  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000877055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  29.32 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  28.57 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  28.57 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3414  AIG2 family protein  29.35 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3573  AIG2 family protein  29.35 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2085  hypothetical protein  35.14 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4134  hypothetical protein  35.71 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  28.57 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2766  hypothetical protein  28.18 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0790  AIG2 family protein  30.85 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2756  AIG2 family protein  30.25 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0708  AIG2 family protein  36.21 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  35.63 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0824  AIG2 family protein  32.26 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0127  hypothetical protein  32.56 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0010  AIG2 family protein  36.11 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3768  AIG2 family protein  30.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3964  hypothetical protein  30.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1224  AIG2 family protein  34 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0570337  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3623  hypothetical protein  30.11 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2119  hypothetical protein  36.21 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2072  AIG2 family protein  32.67 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0261549  normal  0.388782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2053  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00390088  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6024  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0231945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3977  hypothetical protein  30.94 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1478  AIG2 family protein  34.55 
 
 		 135 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5362  hypothetical protein  33.66 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00284222  normal  0.229908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>