42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2844 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4731  hypothetical protein  47.93 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2545  hypothetical protein  45.08 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0875131  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2756  AIG2 family protein  40.46 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4198  hypothetical protein  34.4 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03660  hypothetical protein  34.4 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  40.78 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03711  conserved hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  28.68 
 
 		 598 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  40.57 
 
 		 621 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4565  allophanate hydrolase  40.19 
 
 		 601 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4015  allophanate hydrolase  39.68 
 
 		 611 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  33.82 
 
 		 609 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3721  allophanate hydrolase  39.68 
 
 		 611 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.640157  normal  0.348876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  34.91 
 
 		 624 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1361  amidase family protein  35.24 
 
 		 601 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.73258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  32.58 
 
 		 589 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0724  allophanate hydrolase  35.85 
 
 		 631 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1170  allophanate hydrolase  34.29 
 
 		 606 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  30.2 
 
 		 600 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  30.15 
 
 		 572 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  34.26 
 
 		 596 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  36.27 
 
 		 621 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  38.95 
 
 		 600 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1337  allophanate hydrolase  35.79 
 
 		 590 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1134  allophanate hydrolase  34.26 
 
 		 597 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  36.54 
 
 		 601 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  27.41 
 
 		 1822 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3980  allophanate hydrolase  34.15 
 
 		 609 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1587  allophanate hydrolase  36.27 
 
 		 607 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.556353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  33.33 
 
 		 569 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  36.19 
 
 		 614 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3691  allophanate hydrolase  36.94 
 
 		 599 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.669164  hitchhiker  0.00382205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  28.24 
 
 		 633 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  34 
 
 		 604 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3899  allophanate hydrolase  37.1 
 
 		 603 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  33.05 
 
 		 616 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  35 
 
 		 600 aa  40  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  33.08 
 
 		 623 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0711  allophanate hydrolase  32.84 
 
 		 595 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  27.48 
 
 		 618 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4571  AIG2 family protein  37.1 
 
 		 124 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>