46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4731 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4731  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2545  hypothetical protein  57.38 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0875131  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2844  hypothetical protein  47.93 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0533906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2756  AIG2 family protein  36.8 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03660  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4198  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0832  amidase  33.33 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281479  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4450  allophanate hydrolase  33.59 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  33.33 
 
 		 614 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16950  allophanate hydrolase  36.64 
 
 		 603 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.905265  normal  0.473581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2818  AIG2 family protein  37.76 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0387091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  32.28 
 
 		 589 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03711  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4882  allophanate hydrolase  32.03 
 
 		 609 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00227153  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5244  allophanate hydrolase  28.68 
 
 		 618 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0675  AIG2 family protein  34.58 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0865  AIG2 family protein  35.51 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1367  allophanate hydrolase  28.68 
 
 		 633 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0539112  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0729  AIG2 family protein  34.58 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2164  allophanate hydrolase  30.77 
 
 		 600 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0978  AIG2 family protein  34.58 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0035  allophanate hydrolase  30.89 
 
 		 600 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2915  AIG2 family protein  36.46 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0075  allophanate hydrolase  29.03 
 
 		 600 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0792  AIG2 family protein  33.64 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2891  AIG2 family protein  35.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1106  allophanate hydrolase  27.91 
 
 		 616 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2847  AIG2 family protein  30.65 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2749  allophanate hydrolase  29.37 
 
 		 601 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1005  AIG2 family protein  33.96 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1128  amidase family protein  28.23 
 
 		 598 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3729  allophanate hydrolase  29.55 
 
 		 572 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0581  AIG2 family protein  32.71 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0457143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1893  allophanate hydrolase  31.4 
 
 		 596 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0919605  normal  0.389908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0922  AIG2 family protein  33.65 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  27.78 
 
 		 601 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3031  allophanate hydrolase  31.75 
 
 		 621 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0905  allophanate hydrolase  30.53 
 
 		 565 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0617663  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0704  allophanate hydrolase  29.03 
 
 		 604 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0767  allophanate hydrolase  34.11 
 
 		 569 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4244  amidase family protein  30.77 
 
 		 604 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1793  amidase  29.51 
 
 		 598 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4705  allophanate hydrolase  28.68 
 
 		 596 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291506  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0773  urea amidolyase  31.82 
 
 		 621 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0265  allophanate hydrolase  28.57 
 
 		 569 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33811  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6429  allophanate hydrolase  27.05 
 
 		 623 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>