24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1921 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1921  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.766298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1521  AIG2 family protein  43.18 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.477034  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4935  hypothetical protein  43.41 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4372  hypothetical protein  38.76 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0344  AIG2 family protein  37.98 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0337  AIG2 family protein  37.98 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5148  AIG2 family protein  35.56 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2748399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1507  hypothetical protein  33.58 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2817  AIG2 family protein  33.09 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5268  AIG2 family protein  36.55 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1677  hypothetical protein  29.01 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.160671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1412  hypothetical protein  27.48 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2864  btrG family protein  33.64 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2824  btrG family protein  32.43 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000384171 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2817  btrG family protein  31.53 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2626  btrG family protein  31.53 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0080659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2542  butirosin biosynthesis protein  31.82 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2575  butirosin biosynthesis protein  34.02 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00105071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2479  AIG2 family protein  35.85 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2617  AIG2 family protein  32.98 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0547  AIG2 family protein  42.35 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.112673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1143  AIG2 family protein  41.18 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.224864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2467  btrG family protein  33.64 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0279924  normal  0.35346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  35.83 
 
 
365 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>