More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3188 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
572 aa  1135    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.57 
 
 
576 aa  658    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
810 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  34.88 
 
 
617 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  38.7 
 
 
508 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
1017 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
875 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0908  histidine kinase  35.49 
 
 
388 aa  141  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.18 
 
 
923 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
386 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  38.11 
 
 
347 aa  137  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
979 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
620 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
687 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3246  histidine kinase  31.56 
 
 
826 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
839 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710267  hitchhiker  0.00000913845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  33.94 
 
 
1418 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  36.14 
 
 
945 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
837 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
1014 aa  133  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
508 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
958 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
977 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  33.94 
 
 
629 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
870 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
798 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
453 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
473 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
456 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
484 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
413 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
815 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
757 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
827 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
392 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  33.82 
 
 
1417 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  35.39 
 
 
352 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1173 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
637 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
490 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.46 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  34.18 
 
 
1140 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
934 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  35.19 
 
 
1122 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1140 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1140 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1122 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  33.98 
 
 
910 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
765 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0050  two component sensor kinase  29.65 
 
 
911 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 
1133 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
614 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.2 
 
 
1346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  33.86 
 
 
531 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
399 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
906 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  33.47 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
1010 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
856 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
733 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  33.47 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
754 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.06 
 
 
1322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
579 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
763 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
975 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
511 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  38.53 
 
 
554 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
639 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1274 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0871  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
358 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1070 aa  127  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
973 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1122 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  29.07 
 
 
1111 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
587 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1977  histidine kinase  38.25 
 
 
534 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.313704  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  34.19 
 
 
364 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
921 aa  126  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  37.86 
 
 
497 aa  126  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 
1626 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  35.14 
 
 
725 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.4 
 
 
587 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  36.07 
 
 
595 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  32.93 
 
 
1166 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
596 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
444 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>