36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2792 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  757    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  45.43 
 
 		 369 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  42.98 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  51.49 
 
 		 236 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40647  predicted protein  33.06 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5503  hypothetical protein  34.53 
 
 		 264 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 494 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  38.46 
 
 		 872 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  37.79 
 
 		 873 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  37.79 
 
 		 873 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  26.67 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  25.4 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  30.11 
 
 		 741 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  35.9 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  24.35 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 841 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  29.28 
 
 		 824 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  27.43 
 
 		 230 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  26.26 
 
 		 778 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  25.11 
 
 		 735 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  24.54 
 
 		 785 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  26.49 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  28.98 
 
 		 892 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  29.66 
 
 		 936 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  25.4 
 
 		 725 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  24.07 
 
 		 877 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3715  hypothetical protein  28.46 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2842  hypothetical protein  25.52 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  22.46 
 
 		 735 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  26.94 
 
 		 793 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  21.24 
 
 		 810 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  25.73 
 
 		 881 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4458  hypothetical protein  24.67 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0457578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  34.44 
 
 		 244 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  34.04 
 
 		 245 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>