22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4864 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  53.19 
 
 
369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  51.49 
 
 
379 aa  252  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  53.25 
 
 
356 aa  245  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5503  hypothetical protein  31.23 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614253  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40647  predicted protein  30.98 
 
 
366 aa  118  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  34.25 
 
 
494 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  32.79 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4458  hypothetical protein  26.38 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0457578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  25.27 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  25.12 
 
 
230 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  24.46 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  26.11 
 
 
741 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  29.28 
 
 
808 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2842  hypothetical protein  27 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2015  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  23.86 
 
 
877 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  28.04 
 
 
868 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  25.99 
 
 
725 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  24.53 
 
 
881 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  28.46 
 
 
1050 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>