28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2413 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  100 
 
 
881 aa  1791    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  36.36 
 
 
877 aa  559  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  34.89 
 
 
892 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  35.09 
 
 
936 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  32.02 
 
 
824 aa  347  7e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  29.11 
 
 
872 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  28.05 
 
 
873 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  38.65 
 
 
841 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  25.78 
 
 
810 aa  230  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  27.83 
 
 
873 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  29.03 
 
 
868 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  34.1 
 
 
808 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  29.59 
 
 
735 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  31.55 
 
 
785 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  27.75 
 
 
741 aa  151  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  29.43 
 
 
735 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  27.3 
 
 
725 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  28.8 
 
 
778 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  28.57 
 
 
793 aa  129  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  28.91 
 
 
799 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  26.25 
 
 
803 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  30.21 
 
 
788 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 
799 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 
799 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  30.95 
 
 
790 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  26.33 
 
 
761 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  22.34 
 
 
369 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  24.09 
 
 
356 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>