29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0624 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  100 
 
 		 824 aa  1656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  32.29 
 
 		 892 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  31.85 
 
 		 881 aa  350  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  27.86 
 
 		 877 aa  344  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  29.86 
 
 		 808 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  34.65 
 
 		 841 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  31.01 
 
 		 936 aa  316  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  39.29 
 
 		 868 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  26.78 
 
 		 810 aa  259  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  41.4 
 
 		 873 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  41.15 
 
 		 873 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  41.47 
 
 		 872 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  34.64 
 
 		 735 aa  230  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  34.86 
 
 		 785 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  30.51 
 
 		 741 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  32.23 
 
 		 735 aa  164  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  29.26 
 
 		 725 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  30.46 
 
 		 778 aa  149  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  28.33 
 
 		 793 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  29.77 
 
 		 788 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  27.55 
 
 		 803 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  27.73 
 
 		 799 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  27.73 
 
 		 799 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  27.24 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  27.93 
 
 		 790 aa  127  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  32.67 
 
 		 761 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  27.01 
 
 		 369 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  29.28 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 494 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>