27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4611 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  52.04 
 
 
785 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1506    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  28.87 
 
 
735 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  29.06 
 
 
725 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  25.76 
 
 
741 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  32.95 
 
 
892 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  31.04 
 
 
841 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  32.23 
 
 
824 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  32.32 
 
 
868 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  29.43 
 
 
881 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  26.59 
 
 
877 aa  138  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  28.77 
 
 
873 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  25.99 
 
 
808 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  28.49 
 
 
873 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  27.93 
 
 
872 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  27.66 
 
 
936 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  26.27 
 
 
778 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  24.04 
 
 
803 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  27.66 
 
 
810 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  26.37 
 
 
788 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  25.58 
 
 
793 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  25.83 
 
 
799 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  26.07 
 
 
799 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  24.49 
 
 
790 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  26 
 
 
799 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  20.92 
 
 
761 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  23.79 
 
 
494 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>