31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1054 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  93.24 
 
 
872 aa  1627    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  100 
 
 
873 aa  1754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  98.4 
 
 
873 aa  1731    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  43.87 
 
 
868 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  30.85 
 
 
936 aa  267  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  41.58 
 
 
824 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  28.85 
 
 
892 aa  254  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  25.82 
 
 
877 aa  239  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  27.83 
 
 
881 aa  230  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  44.88 
 
 
841 aa  212  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  31.35 
 
 
808 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  32.73 
 
 
735 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  30.61 
 
 
741 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  28.23 
 
 
810 aa  142  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  27.39 
 
 
778 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  28.77 
 
 
735 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  27.65 
 
 
803 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  33.33 
 
 
761 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  28.79 
 
 
725 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  29.91 
 
 
788 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  27.25 
 
 
785 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  26.67 
 
 
799 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  26.67 
 
 
799 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  26.95 
 
 
799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  25.7 
 
 
793 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  29.02 
 
 
790 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  36.32 
 
 
379 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  30.82 
 
 
494 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  25.81 
 
 
356 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  24.48 
 
 
369 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  27.07 
 
 
1120 aa  48.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>