33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0563 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  772    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  46.17 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  43.47 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  53.19 
 
 		 236 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40647  predicted protein  31.02 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5503  hypothetical protein  30.11 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  27.57 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  27.66 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  27.85 
 
 		 725 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  28.37 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  27.84 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03943  hypothetical protein  30.4 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4458  hypothetical protein  24.74 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0457578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  26.19 
 
 		 741 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3715  hypothetical protein  25.68 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  25.13 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  22.34 
 
 		 881 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  26.73 
 
 		 824 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2842  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  24.23 
 
 		 230 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  25 
 
 		 873 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  25.47 
 
 		 868 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4163  hypothetical protein  22.61 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2015  hypothetical protein  24.16 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.84 
 
 		 1657 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  34.78 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  25 
 
 		 873 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0595  hypothetical protein  21.5 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  25.6 
 
 		 872 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0787  hypothetical protein  25.64 
 
 		 474 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  23.85 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>