13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0482 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  80.37 
 
 
221 aa  357  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2015  hypothetical protein  34.29 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  26.02 
 
 
494 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  28.5 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  23.23 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  25.12 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  24.44 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  26.55 
 
 
379 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  21.32 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  24.23 
 
 
369 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4458  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0457578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2842  hypothetical protein  21.95 
 
 
215 aa  42  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>