21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2035 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  725    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  43.47 
 
 
369 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  42.42 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  53.25 
 
 
236 aa  245  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5503  hypothetical protein  31.39 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614253  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40647  predicted protein  31.2 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  29.11 
 
 
494 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  30.48 
 
 
741 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  25.52 
 
 
223 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  22.62 
 
 
245 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  25.64 
 
 
221 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  24 
 
 
232 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  30.32 
 
 
725 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  21.32 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  25 
 
 
735 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  24.09 
 
 
881 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03943  hypothetical protein  26.92 
 
 
253 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  24.44 
 
 
808 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  26.32 
 
 
873 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  32.58 
 
 
244 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>